Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN5AQ14524 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
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