Protein–RNA interactions for Protein: Q12491

TY2B-B, Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-BQ12491 FUM1YPL262W 1467 nt7.3□□□□□ -1.24
TY2B-BQ12491 STE50YCL032W 1041 nt7.3□□□□□ -1.24
TY2B-BQ12491 YJL107CYJL107C 1164 nt7.29□□□□□ -1.24
TY2B-BQ12491 NMD4YLR363C 657 nt7.29□□□□□ -1.24
TY2B-BQ12491 RAT1YOR048C 3021 nt7.29□□□□□ -1.24
TY2B-BQ12491 BPL1YDL141W 2073 nt7.29□□□□□ -1.24
TY2B-BQ12491 RRP3YHR065C 1506 nt7.28□□□□□ -1.24
TY2B-BQ12491 MPM1YJL066C 759 nt7.28□□□□□ -1.24
TY2B-BQ12491 MTC5YDR128W 3447 nt7.28□□□□□ -1.24
TY2B-BQ12491 RIA1YNL163C 3333 nt7.28□□□□□ -1.24
TY2B-BQ12491 RRP40YOL142W 723 nt7.28□□□□□ -1.24
TY2B-BQ12491 DBP8YHR169W 1296 nt7.27□□□□□ -1.25
TY2B-BQ12491 SED4YCR067C 3198 nt7.27□□□□□ -1.25
TY2B-BQ12491 AMA1YGR225W 1782 nt7.26□□□□□ -1.25
TY2B-BQ12491 CLB2YPR119W 1476 nt7.26□□□□□ -1.25
TY2B-BQ12491 TUB3YML124C 1338 nt7.26□□□□□ -1.25
TY2B-BQ12491 IMA2YOL157C 1770 nt7.26□□□□□ -1.25
TY2B-BQ12491 CUE2YKL090W 1332 nt7.26□□□□□ -1.25
TY2B-BQ12491 NKP2YLR315W 462 nt7.25□□□□□ -1.25
TY2B-BQ12491 UBI4YLL039C 1146 nt7.25□□□□□ -1.25
TY2B-BQ12491 TMA17YDL110C 453 nt7.24□□□□□ -1.25
TY2B-BQ12491 YDR417CYDR417C 372 nt7.24□□□□□ -1.25
TY2B-BQ12491 ASK10YGR097W 3441 nt7.24□□□□□ -1.25
TY2B-BQ12491 ALG6YOR002W 1635 nt7.23□□□□□ -1.25
TY2B-BQ12491 DPH6YLR143W 2058 nt7.23□□□□□ -1.25
TY2B-BQ12491 YGR153WYGR153W 654 nt7.23□□□□□ -1.25
TY2B-BQ12491 RAP1YNL216W 2484 nt7.22□□□□□ -1.25
TY2B-BQ12491 CLP1YOR250C 1338 nt7.22□□□□□ -1.25
TY2B-BQ12491 VHS1YDR247W 1386 nt7.22□□□□□ -1.25
TY2B-BQ12491 YMR196WYMR196W 3267 nt7.22□□□□□ -1.25
TY2B-BQ12491 APC4YDR118W 1959 nt7.22□□□□□ -1.25
TY2B-BQ12491 PTK2YJR059W 2457 nt7.21□□□□□ -1.25
TY2B-BQ12491 IDP3YNL009W 1263 nt7.21□□□□□ -1.25
TY2B-BQ12491 YNL181WYNL181W 1224 nt7.21□□□□□ -1.25
TY2B-BQ12491 RTC5YOR118W 1704 nt7.21□□□□□ -1.26
TY2B-BQ12491 RGD1YBR260C 2001 nt7.21□□□□□ -1.26
TY2B-BQ12491 TBF1YPL128C 1689 nt7.21□□□□□ -1.26
TY2B-BQ12491 YGL152CYGL152C 678 nt7.2□□□□□ -1.26
TY2B-BQ12491 MRPL20YKR085C 588 nt7.2□□□□□ -1.26
TY2B-BQ12491 TLG2YOL018C 1194 nt7.2□□□□□ -1.26
TY2B-BQ12491 YMR245WYMR245W 621 nt7.2□□□□□ -1.26
TY2B-BQ12491 RAD30YDR419W 1899 nt7.19□□□□□ -1.26
TY2B-BQ12491 SSZ1YHR064C 1617 nt7.19□□□□□ -1.26
TY2B-BQ12491 SLT2YHR030C 1455 nt7.18□□□□□ -1.26
TY2B-BQ12491 VCX1YDL128W 1236 nt7.18□□□□□ -1.26
TY2B-BQ12491 YER145C-AYER145C-A 438 nt7.18□□□□□ -1.26
TY2B-BQ12491 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt7.18□□□□□ -1.26
TY2B-BQ12491 MTF1YMR228W 1026 nt7.18□□□□□ -1.26
TY2B-BQ12491 YPR071WYPR071W 636 nt7.18□□□□□ -1.26
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TY2B-BQ12491 RIO1YOR119C 1455 nt7.18□□□□□ -1.26
TY2B-BQ12491 SNA2YDR525W-A 240 nt7.18□□□□□ -1.26
TY2B-BQ12491 CBF5YLR175W 1452 nt7.17□□□□□ -1.26
TY2B-BQ12491 RET1YOR207C 3450 nt7.17□□□□□ -1.26
TY2B-BQ12491 KRE28YDR532C 1158 nt7.17□□□□□ -1.26
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TY2B-BQ12491 YCR061WYCR061W 1896 nt7.14□□□□□ -1.27
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TY2B-BQ12491 RER1YCL001W 567 nt7.13□□□□□ -1.27
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TY2B-BQ12491 AIM7YDR063W 450 nt7.12□□□□□ -1.27
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TY2B-BQ12491 YMR102CYMR102C 2505 nt7.12□□□□□ -1.27
TY2B-BQ12491 SUP35YDR172W 2058 nt7.11□□□□□ -1.27
TY2B-BQ12491 ROT2YBR229C 2865 nt7.11□□□□□ -1.27
TY2B-BQ12491 RSC6YCR052W 1452 nt7.11□□□□□ -1.27
TY2B-BQ12491 PHM7YOL084W 2976 nt7.11□□□□□ -1.27
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TY2B-BQ12491 RSC4YKR008W 1878 nt7.1□□□□□ -1.27
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TY2B-BQ12491 RIM101YHL027W 1878 nt7.08□□□□□ -1.28
TY2B-BQ12491 RPL14AYKL006W 417 nt7.08□□□□□ -1.28
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TY2B-BQ12491 BRE2YLR015W 1518 nt7.08□□□□□ -1.28
TY2B-BQ12491 HXT14YNL318C 1623 nt7.08□□□□□ -1.28
TY2B-BQ12491 FRA2YGL220W 363 nt7.08□□□□□ -1.28
TY2B-BQ12491 RRN9YMR270C 1098 nt7.08□□□□□ -1.28
TY2B-BQ12491 MID2YLR332W 1131 nt7.07□□□□□ -1.28
TY2B-BQ12491 MET12YPL023C 1974 nt7.07□□□□□ -1.28
TY2B-BQ12491 CTS2YDR371W 1536 nt7.06□□□□□ -1.28
TY2B-BQ12491 ARB1YER036C 1833 nt7.06□□□□□ -1.28
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