Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 snR3snR3 194 nt5.28□□□□□ -1.56
NMD4Q12129 MAL13YGR288W 1422 nt5.28□□□□□ -1.56
NMD4Q12129 BAP2YBR068C 1830 nt5.27□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 FLC3YGL139W 2409 nt5.27□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 COX26YDR119W-A 201 nt5.27□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 YGR176WYGR176W 348 nt5.27□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.27□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 GRE3YHR104W 984 nt5.27□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 MRP17YKL003C 396 nt5.27□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 SSP120YLR250W 705 nt5.27□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 MEC3YLR288C 1425 nt5.27□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 MRPL36YBR122C 534 nt5.27□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 RRT2YBR246W 1164 nt5.27□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 SNT2YGL131C 4212 nt5.27□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 UTP7YER082C 1665 nt5.27□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 UTP18YJL069C 1785 nt5.27□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 IBA57YJR122W 1494 nt5.26□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 IFM1YOL023W 2031 nt5.26□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 YDL172CYDL172C 480 nt5.26□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 GIR2YDR152W 798 nt5.26□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 YDR445CYDR445C 408 nt5.26□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 YGL118CYGL118C 438 nt5.26□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 YGL262WYGL262W 528 nt5.26□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 YIL028WYIL028W 399 nt5.26□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 YKR104WYKR104W 921 nt5.26□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 YLR402WYLR402W 192 nt5.26□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 RHO2YNL090W 579 nt5.26□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 RGT1YKL038W 3513 nt5.26□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 CDC19YAL038W 1503 nt5.26□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 FKH1YIL131C 1455 nt5.26□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 SHE10YGL228W 1734 nt5.26□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 ISR1YPR106W 1332 nt5.25□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 SAS4YDR181C 1446 nt5.25□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 DBR1YKL149C 1218 nt5.25□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 ECM1YAL059W 639 nt5.25□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 YLL059CYLL059C 507 nt5.25□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 YNR068CYNR068C 819 nt5.25□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 MRL1YPR079W 1146 nt5.25□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 NOT3YIL038C 2511 nt5.24□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.24□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 BUR6YER159C 429 nt5.24□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 YIL060WYIL060W 435 nt5.24□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 RPL3YOR063W 1164 nt5.24□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 ENV9YOR246C 993 nt5.24□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 YPL073CYPL073C 486 nt5.24□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 CTR1YPR124W 1221 nt5.24□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 YPR195CYPR195C 330 nt5.24□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.24□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 YAP1801YHR161C 1914 nt5.23□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 MTQ2YDR140W 666 nt5.23□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 MTC2YKL098W 1074 nt5.23□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 PSR1YLL010C 1284 nt5.23□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 CPA1YOR303W 1236 nt5.23□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 MPC54YOR177C 1395 nt5.23□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.23□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 RNR3YIL066C 2610 nt5.23□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 ROG3YFR022W 2202 nt5.23□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 OMS1YDR316W 1416 nt5.23□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 VTC2YFL004W 2487 nt5.22□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 ASH1YKL185W 1767 nt5.22□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 ACC1YNR016C 6702 nt5.22□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 YDL034WYDL034W 345 nt5.22□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 VCX1YDL128W 1236 nt5.22□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 PCL9YDL179W 915 nt5.22□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 YDL183CYDL183C 963 nt5.22□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 HEM3YDL205C 984 nt5.22□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 TIP20YGL145W 2106 nt5.22□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.22□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.22□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.22□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.22□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.22□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.22□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.22□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.22□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.22□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.22□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 YHR214WYHR214W 612 nt5.22□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 NTR2YKR022C 969 nt5.22□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 YLR124WYLR124W 345 nt5.22□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 DCN1YLR128W 810 nt5.22□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 VTA1YLR181C 993 nt5.22□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 YAR066WYAR066W 612 nt5.22□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 PGA2YNL149C 390 nt5.22□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 CSL4YNL232W 879 nt5.22□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 ISA2YPR067W 558 nt5.22□□□□□ -1.57
NMD4Q12129 LUC7YDL087C 786 nt5.21□□□□□ -1.58
NMD4Q12129 YGR066CYGR066C 879 nt5.21□□□□□ -1.58
NMD4Q12129 TFS1YLR178C 660 nt5.21□□□□□ -1.58
NMD4Q12129 HOR7YMR251W-A 180 nt5.21□□□□□ -1.58
NMD4Q12129 UBC4YBR082C 447 nt5.21□□□□□ -1.58
NMD4Q12129 RSC30YHR056C 2652 nt5.21□□□□□ -1.58
NMD4Q12129 ALT1YLR089C 1779 nt5.21□□□□□ -1.58
NMD4Q12129 RFA1YAR007C 1866 nt5.2□□□□□ -1.58
NMD4Q12129 UBP9YER098W 2265 nt5.2□□□□□ -1.58
NMD4Q12129 CST6YIL036W 1764 nt5.2□□□□□ -1.58
NMD4Q12129 snR57snR57 88 nt5.2□□□□□ -1.58
NMD4Q12129 YLR296WYLR296W 327 nt5.2□□□□□ -1.58
NMD4Q12129 DAL82YNL314W 768 nt5.2□□□□□ -1.58
NMD4Q12129 GEP3YOR205C 1671 nt5.2□□□□□ -1.58
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