Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	SEH1	YGL100W	1050 nt		5.86	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	YOR024W	YOR024W	324 nt		5.86	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	PDB1	YBR221C	1101 nt		5.86	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	PDC1	YLR044C	1692 nt		5.85	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	CDS1	YBR029C	1374 nt		5.85	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	EAF5	YEL018W	840 nt		5.85	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	BGL2	YGR282C	942 nt		5.85	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	PDR16	YNL231C	1056 nt		5.85	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	CKB2	YOR039W	777 nt		5.85	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	CAM1	YPL048W	1248 nt		5.85	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	HAL1	YPR005C	885 nt		5.85	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	MCX1	YBR227C	1563 nt		5.84	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	YKR041W	YKR041W	753 nt		5.84	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	MRPL15	YLR312W-A	762 nt		5.84	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	MRPL4	YLR439W	960 nt		5.84	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	YIL067C	YIL067C	2037 nt		5.84	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	YCR075W-A	YCR075W-A	228 nt		5.83	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	ERD1	YDR414C	1089 nt		5.83	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	NQM1	YGR043C	1002 nt		5.83	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	TOM5	YPR133W-A	153 nt		5.83	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	CYK3	YDL117W	2658 nt		5.83	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	NTH2	YBR001C	2343 nt		5.82	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	YEL077C	YEL077C	3834 nt		5.82	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	JEM1	YJL073W	1938 nt		5.82	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	ASF2	YDL197C	1578 nt		5.82	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	JAC1	YGL018C	555 nt		5.82	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	RGT1	YKL038W	3513 nt		5.82	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	YOR1	YGR281W	4434 nt		5.81	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	SIA1	YOR137C	1869 nt		5.81	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	RBA50	YDR527W	1320 nt		5.81	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	RCK1	YGL158W	1539 nt		5.81	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	YKR073C	YKR073C	321 nt		5.81	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	SEC17	YBL050W	879 nt		5.81	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	YNL194C	YNL194C	906 nt		5.81	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	VID30	YGL227W	2877 nt		5.81	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	THP1	YOL072W	1368 nt		5.8	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	TUL1	YKL034W	2277 nt		5.8	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	NIT2	YJL126W	924 nt		5.8	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	ADE4	YMR300C	1533 nt		5.79	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	GLT1	YDL171C	6438 nt		5.79	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	PTR2	YKR093W	1806 nt		5.79	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	ADK2	YER170W	678 nt		5.79	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	PUS6	YGR169C	1215 nt		5.79	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	ARP1	YHR129C	1155 nt		5.79	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	EXO1	YOR033C	2109 nt		5.79	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	DBF4	YDR052C	2115 nt		5.78	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	COT1	YOR316C	1320 nt		5.78	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	ABZ1	YNR033W	2364 nt		5.78	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	IWR1	YDL115C	1062 nt		5.78	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	MF(ALPHA)2	YGL089C	363 nt		5.78	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	YGR035W-A	YGR035W-A	222 nt		5.78	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	ECM15	YBL001C	315 nt		5.78	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	YBR016W	YBR016W	387 nt		5.78	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	DRN1	YGR093W	1524 nt		5.78	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	NGL2	YMR285C	1548 nt		5.78	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	CLB4	YLR210W	1383 nt		5.78	□□□□□ -1.48
MRD1	Q06106	NOT3	YIL038C	2511 nt		5.77	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	PEX22	YAL055W	543 nt		5.77	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	DOM34	YNL001W	1161 nt		5.77	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	YNL228W	YNL228W	777 nt		5.77	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	ECM33	YBR078W	1290 nt		5.77	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	SIR2	YDL042C	1689 nt		5.77	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	NOP8	YOL144W	1455 nt		5.77	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	FAU1	YER183C	636 nt		5.76	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	ARO2	YGL148W	1131 nt		5.76	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	VPS29	YHR012W	849 nt		5.76	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	NSG1	YHR133C	876 nt		5.76	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	KTI12	YKL110C	942 nt		5.76	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	RFA2	YNL312W	822 nt		5.76	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	ELC1	YPL046C	300 nt		5.76	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	RIM15	YFL033C	5313 nt		5.75	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	MET7	YOR241W	1647 nt		5.75	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	SCM3	YDL139C	672 nt		5.75	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	PEX7	YDR142C	1128 nt		5.75	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	YEL053W-A	YEL053W-A	348 nt		5.75	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	CAB4	YGR277C	918 nt		5.75	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	MTW1	YAL034W-A	870 nt		5.75	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	ATG33	YLR356W	594 nt		5.75	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	YML131W	YML131W	1098 nt		5.75	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	RPL3	YOR063W	1164 nt		5.75	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	BSC5	YNR069C	1470 nt		5.75	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	MKC7	YDR144C	1791 nt		5.75	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	ATE1	YGL017W	1512 nt		5.74	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	DBP8	YHR169W	1296 nt		5.74	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	FUN19	YAL034C	1242 nt		5.74	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	PRS1	YKL181W	1284 nt		5.74	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	OCA1	YNL099C	717 nt		5.74	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	FEX1	YOR390W	1128 nt		5.74	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	FEX2	YPL279C	1128 nt		5.74	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	PRR1	YKL116C	1557 nt		5.74	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	IMA1	YGR287C	1770 nt		5.74	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	NRD1	YNL251C	1728 nt		5.74	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	CTS2	YDR371W	1536 nt		5.74	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	SER33	YIL074C	1410 nt		5.74	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	ELP2	YGR200C	2367 nt		5.73	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	UBX2	YML013W	1755 nt		5.73	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	VHS1	YDR247W	1386 nt		5.73	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	MRF1	YGL143C	1242 nt		5.73	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	YGL185C	YGL185C	1140 nt		5.73	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	SCW10	YMR305C	1170 nt		5.73	□□□□□ -1.49

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 49.5 ms