Protein–RNA interactions for Protein: Q03390

VPS60, Vacuolar protein-sorting-associated protein 60, yeastyeast

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS60Q03390 VHC1YBR235W 3363 nt5.42□□□□□ -1.54
VPS60Q03390 PAN1YIR006C 4443 nt5.42□□□□□ -1.54
VPS60Q03390 YDL023CYDL023C 321 nt5.42□□□□□ -1.54
VPS60Q03390 RPL34AYER056C-A 366 nt5.42□□□□□ -1.54
VPS60Q03390 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt5.42□□□□□ -1.54
VPS60Q03390 TLG2YOL018C 1194 nt5.42□□□□□ -1.54
VPS60Q03390 ZPS1YOL154W 750 nt5.42□□□□□ -1.54
VPS60Q03390 TUL1YKL034W 2277 nt5.41□□□□□ -1.54
VPS60Q03390 GIR2YDR152W 798 nt5.41□□□□□ -1.54
VPS60Q03390 TDH3YGR192C 999 nt5.41□□□□□ -1.54
VPS60Q03390 CPR6YLR216C 1116 nt5.41□□□□□ -1.54
VPS60Q03390 MRPL22YNL177C 930 nt5.41□□□□□ -1.54
VPS60Q03390 PDR16YNL231C 1056 nt5.41□□□□□ -1.54
VPS60Q03390 KTR3YBR205W 1215 nt5.41□□□□□ -1.54
VPS60Q03390 PSE1YMR308C 3270 nt5.41□□□□□ -1.54
VPS60Q03390 SEC39YLR440C 2130 nt5.41□□□□□ -1.54
VPS60Q03390 KAP114YGL241W 3015 nt5.4□□□□□ -1.54
VPS60Q03390 HXT7YDR342C 1713 nt5.4□□□□□ -1.54
VPS60Q03390 HXT6YDR343C 1713 nt5.4□□□□□ -1.54
VPS60Q03390 MPS3YJL019W 2049 nt5.4□□□□□ -1.54
VPS60Q03390 MNN11YJL183W 1269 nt5.4□□□□□ -1.54
VPS60Q03390 TGS1YPL157W 948 nt5.4□□□□□ -1.54
VPS60Q03390 BUD22YMR014W 1560 nt5.4□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 PHO8YDR481C 1701 nt5.4□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 OPT1YJL212C 2400 nt5.39□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 SIT1YEL065W 1887 nt5.39□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 PCA1YBR295W 3651 nt5.39□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 YMR155WYMR155W 1644 nt5.39□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 THI5YFL058W 1023 nt5.39□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 IPI1YHR085W 1005 nt5.39□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 FUN19YAL034C 1242 nt5.39□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 THI12YNL332W 1023 nt5.39□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 TUB3YML124C 1338 nt5.39□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 MDR1YGR100W 2853 nt5.38□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 CLA4YNL298W 2529 nt5.38□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 CBP4YGR174C 513 nt5.38□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 RPB4YJL140W 666 nt5.38□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 YJR115WYJR115W 510 nt5.38□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 YKL023WYKL023W 834 nt5.38□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 MAP2YBL091C 1266 nt5.38□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 SFT2YBL102W 648 nt5.38□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 PDB1YBR221C 1101 nt5.38□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 NOB1YOR056C 1380 nt5.38□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 YPL245WYPL245W 1365 nt5.38□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 GPR1YDL035C 2886 nt5.37□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 BOP2YLR267W 1713 nt5.37□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 VID22YLR373C 2706 nt5.37□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 CAX4YGR036C 720 nt5.37□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 YHR127WYHR127W 732 nt5.37□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 YJL068CYJL068C 900 nt5.37□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 RER2YBR002C 861 nt5.37□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 TRS33YOR115C 807 nt5.37□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 CBF1YJR060W 1056 nt5.36□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 MRP17YKL003C 396 nt5.36□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 SHP1YBL058W 1272 nt5.36□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 RBA50YDR527W 1320 nt5.36□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 IMD3YLR432W 1572 nt5.35□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 KDX1YKL161C 1302 nt5.35□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 ASA1YPR085C 1332 nt5.35□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 TFB3YDR460W 966 nt5.35□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 DCN1YLR128W 810 nt5.35□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 SEC17YBL050W 879 nt5.35□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 RPO26YPR187W 468 nt5.35□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 KAR2YJL034W 2049 nt5.35□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 SKG3YLR187W 3081 nt5.34□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 CTS2YDR371W 1536 nt5.34□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 DEF1YKL054C 2217 nt5.34□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 SCM3YDL139C 672 nt5.34□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 SEH1YGL100W 1050 nt5.34□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 CTR2YHR175W 570 nt5.34□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 PGU1YJR153W 1086 nt5.34□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 YML057C-AYML057C-A 390 nt5.34□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 YPL113CYPL113C 1191 nt5.34□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 YTH1YPR107C 627 nt5.34□□□□□ -1.55
VPS60Q03390 RAD16YBR114W 2373 nt5.34□□□□□ -1.56
VPS60Q03390 ELP3YPL086C 1674 nt5.34□□□□□ -1.56
VPS60Q03390 HOT1YMR172W 2160 nt5.33□□□□□ -1.56
VPS60Q03390 YHL049CYHL049C 816 nt5.33□□□□□ -1.56
VPS60Q03390 APJ1YNL077W 1587 nt5.33□□□□□ -1.56
VPS60Q03390 SFI1YLL003W 2841 nt5.32□□□□□ -1.56
VPS60Q03390 ARP1YHR129C 1155 nt5.32□□□□□ -1.56
VPS60Q03390 HSP82YPL240C 2130 nt5.32□□□□□ -1.56
VPS60Q03390 BRL1YHR036W 1416 nt5.31□□□□□ -1.56
VPS60Q03390 ARG1YOL058W 1263 nt5.31□□□□□ -1.56
VPS60Q03390 snR19snR19 568 nt5.31□□□□□ -1.56
VPS60Q03390 YAP1YML007W 1953 nt5.31□□□□□ -1.56
VPS60Q03390 THI20YOL055C 1656 nt5.31□□□□□ -1.56
VPS60Q03390 YDL119CYDL119C 924 nt5.3□□□□□ -1.56
VPS60Q03390 YIM1YMR152W 1098 nt5.3□□□□□ -1.56
VPS60Q03390 YPL102CYPL102C 303 nt5.3□□□□□ -1.56
VPS60Q03390 YMR102CYMR102C 2505 nt5.3□□□□□ -1.56
VPS60Q03390 FRS1YLR060W 1788 nt5.29□□□□□ -1.56
VPS60Q03390 LYS5YGL154C 819 nt5.29□□□□□ -1.56
VPS60Q03390 PMA1YGL008C 2757 nt5.29□□□□□ -1.56
VPS60Q03390 MOT2YER068W 1764 nt5.29□□□□□ -1.56
VPS60Q03390 YJR124CYJR124C 1347 nt5.28□□□□□ -1.56
VPS60Q03390 MET7YOR241W 1647 nt5.28□□□□□ -1.56
VPS60Q03390 NCS6YGL211W 1080 nt5.28□□□□□ -1.56
VPS60Q03390 YGR153WYGR153W 654 nt5.28□□□□□ -1.56
VPS60Q03390 MAK3YPR051W 531 nt5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 76.5 ms