Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
UBXN2AP68543 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBXN2AP68543 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
UBXN2AP68543 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBXN2AP68543 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBXN2AP68543 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBXN2AP68543 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBXN2AP68543 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBXN2AP68543 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBXN2AP68543 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBXN2AP68543 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBXN2AP68543 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBXN2AP68543 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBXN2AP68543 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
UBXN2AP68543 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
UBXN2AP68543 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBXN2AP68543 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBXN2AP68543 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
UBXN2AP68543 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBXN2AP68543 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBXN2AP68543 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBXN2AP68543 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBXN2AP68543 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBXN2AP68543 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBXN2AP68543 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBXN2AP68543 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBXN2AP68543 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBXN2AP68543 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBXN2AP68543 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBXN2AP68543 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBXN2AP68543 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBXN2AP68543 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
UBXN2AP68543 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBXN2AP68543 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBXN2AP68543 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms