Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB3P05106 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1016.1 ms