Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX3O95343 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX3O95343 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX3O95343 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIX3O95343 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIX3O95343 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIX3O95343 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIX3O95343 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIX3O95343 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIX3O95343 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX3O95343 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX3O95343 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX3O95343 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX3O95343 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX3O95343 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX3O95343 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX3O95343 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX3O95343 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX3O95343 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX3O95343 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX3O95343 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX3O95343 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX3O95343 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX3O95343 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX3O95343 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX3O95343 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX3O95343 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIX3O95343 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIX3O95343 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIX3O95343 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIX3O95343 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIX3O95343 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIX3O95343 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIX3O95343 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIX3O95343 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIX3O95343 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIX3O95343 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIX3O95343 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIX3O95343 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIX3O95343 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIX3O95343 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIX3O95343 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX3O95343 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX3O95343 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX3O95343 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX3O95343 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX3O95343 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX3O95343 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX3O95343 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX3O95343 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX3O95343 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX3O95343 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX3O95343 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIX3O95343 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIX3O95343 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIX3O95343 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIX3O95343 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIX3O95343 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SIX3O95343 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIX3O95343 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIX3O95343 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIX3O95343 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIX3O95343 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIX3O95343 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIX3O95343 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SIX3O95343 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIX3O95343 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIX3O95343 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIX3O95343 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIX3O95343 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIX3O95343 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIX3O95343 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIX3O95343 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIX3O95343 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIX3O95343 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIX3O95343 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX3O95343 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX3O95343 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX3O95343 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX3O95343 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX3O95343 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX3O95343 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX3O95343 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX3O95343 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX3O95343 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX3O95343 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX3O95343 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX3O95343 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX3O95343 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX3O95343 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX3O95343 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX3O95343 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX3O95343 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX3O95343 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX3O95343 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX3O95343 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX3O95343 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX3O95343 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX3O95343 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX3O95343 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms