Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.525e-7■■■■■ 41.9
DKC1O60832 RPTOR-211ENST00000577161 3633 ntTSL 211.61□□□□□ -0.559e-7■■■■■ 41.9
DKC1O60832 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.717e-7■■■■■ 41.9
DKC1O60832 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.257e-7■■■■■ 41.9
DKC1O60832 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.11e-7■■■■■ 41.8
DKC1O60832 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.081e-7■■■■■ 41.8
DKC1O60832 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.171e-7■■■■■ 41.8
DKC1O60832 ARHGEF7-210ENST00000449979 682 ntTSL 518.45■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 41.8
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DKC1O60832 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.211e-7■■■■■ 41.8
DKC1O60832 ARHGEF7-212ENST00000467053 691 ntTSL 315.75■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 41.8
DKC1O60832 PECR-202ENST00000442122 1100 ntTSL 215.53■□□□□ 0.082e-17■■■■■ 41.8
DKC1O60832 ARHGEF7-211ENST00000466143 1681 ntTSL 515.47■□□□□ 0.071e-7■■■■■ 41.8
DKC1O60832 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.051e-7■■■■■ 41.8
DKC1O60832 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.052e-17■■■■■ 41.8
DKC1O60832 FAM156A-223ENST00000623782 1931 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.12e-17■■■■■ 41.8
DKC1O60832 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.112e-17■■■■■ 41.8
DKC1O60832 FAM156A-203ENST00000611661 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.112e-17■■■■■ 41.8
DKC1O60832 FAM156A-222ENST00000622732 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 414.05□□□□□ -0.162e-17■■■■■ 41.8
DKC1O60832 FAM156A-220ENST00000622430 576 ntTSL 413.94□□□□□ -0.182e-17■■■■■ 41.8
DKC1O60832 ARHGEF7-213ENST00000469877 1501 ntTSL 213.57□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 41.8
DKC1O60832 SPTBN1-203ENST00000389980 2164 ntTSL 1 (best)13.45□□□□□ -0.262e-17■■■■■ 41.8
DKC1O60832 FAM156A-202ENST00000610625 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 313.39□□□□□ -0.272e-17■■■■■ 41.8
DKC1O60832 ARHGEF7-218ENST00000491775 581 ntTSL 413.01□□□□□ -0.331e-7■■■■■ 41.8
DKC1O60832 SPTBN1-202ENST00000356805 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.392e-17■■■■■ 41.8
DKC1O60832 FAM156A-219ENST00000622323 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 312.07□□□□□ -0.482e-17■■■■■ 41.8
DKC1O60832 SPTBN1-201ENST00000333896 9075 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.612e-17■■■■■ 41.8
DKC1O60832 RBFOX2-202ENST00000359369 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.622e-8■■■■■ 41.8
DKC1O60832 FAM156A-204ENST00000612083 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 410.99□□□□□ -0.652e-17■■■■■ 41.8
DKC1O60832 FAM156A-211ENST00000616592 319 ntTSL 210.74□□□□□ -0.692e-17■■■■■ 41.8
DKC1O60832 SPTBN1-207ENST00000615901 10226 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.772e-17■■■■■ 41.8
DKC1O60832 FAM156A-217ENST00000619897 784 ntTSL 410□□□□□ -0.812e-17■■■■■ 41.8
DKC1O60832 RERE-207ENST00000464972 743 ntTSL 58.97□□□□□ -0.972e-17■■■■■ 41.8
DKC1O60832 FAM156A-209ENST00000615171 590 ntTSL 48.56□□□□□ -1.042e-17■■■■■ 41.8
DKC1O60832 RBFOX2-206ENST00000408983 663 ntTSL 38.5□□□□□ -1.052e-8■■■■■ 41.8
DKC1O60832 RAPGEF2-206ENST00000505478 838 ntTSL 55.13□□□□□ -1.592e-17■■■■■ 41.8
DKC1O60832 BTBD2-206ENST00000589200 858 ntTSL 525.01■■□□□ 1.591e-7■■■■■ 41.8
DKC1O60832 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.511e-7■■■■■ 41.8
DKC1O60832 BTBD2-208ENST00000590646 572 ntTSL 416.62■□□□□ 0.251e-7■■■■■ 41.8
DKC1O60832 BTBD2-205ENST00000588395 352 ntTSL 515.87■□□□□ 0.131e-7■■■■■ 41.8
DKC1O60832 BTBD2-203ENST00000587742 559 ntTSL 515.42■□□□□ 0.061e-7■■■■■ 41.8
DKC1O60832 SHANK2-215ENST00000470759 762 ntTSL 521.16■□□□□ 0.984e-7■■■■■ 41.8
DKC1O60832 NUP210-202ENST00000420141 3134 ntTSL 1 (best)23.83■■□□□ 1.412e-6■■■■■ 41.8
DKC1O60832 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 41.8
DKC1O60832 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.878e-19■■■■■ 41.7
DKC1O60832 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.958e-19■■■■■ 41.7
DKC1O60832 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.338e-19■■■■■ 41.7
DKC1O60832 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 41.6
DKC1O60832 CDK6-203ENST00000467166 779 ntTSL 28.12□□□□□ -1.113e-42■■■■■ 41.6
DKC1O60832 CEP72-203ENST00000512038 656 ntTSL 218.93■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 41.6
DKC1O60832 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.643e-8■■■■■ 41.5
DKC1O60832 MCF2L-227ENST00000486806 361 ntTSL 310.71□□□□□ -0.698e-9■■■■■ 41.5
DKC1O60832 SNORA5C-201ENST00000364902 137 ntBASIC11.65□□□□□ -0.541e-323■■■■■ 41.5
DKC1O60832 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.774e-15■■■■■ 41.3
DKC1O60832 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.629e-7■■■■■ 41.3
DKC1O60832 MCF2L-210ENST00000409954 574 ntTSL 516.34■□□□□ 0.219e-7■■■■■ 41.3
DKC1O60832 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.159e-7■■■■■ 41.3
DKC1O60832 MCF2L-202ENST00000375597 3413 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.469e-7■■■■■ 41.3
DKC1O60832 IL11RA-209ENST00000555247 1669 ntTSL 527.05■■□□□ 1.922e-6■■■■■ 41.3
DKC1O60832 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 41.3
DKC1O60832 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 41.3
DKC1O60832 IL11RA-206ENST00000553620 491 ntTSL 516.39■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 41.3
DKC1O60832 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 41.3
DKC1O60832 NUMBL-206ENST00000598773 834 ntTSL 524.65■■□□□ 1.541e-6■■■■■ 41.2
DKC1O60832 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.672e-7■■■■■ 41.2
DKC1O60832 PIGU-201ENST00000217446 1632 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best)17.65■□□□□ 0.422e-7■■■■■ 41.2
DKC1O60832 PIGU-203ENST00000438215 509 ntTSL 310.1□□□□□ -0.792e-7■■■■■ 41.2
DKC1O60832 AC015802.4-201ENST00000589963 578 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.94e-7■■■■■ 41.2
DKC1O60832 SLC26A11-207ENST00000571564 714 ntTSL 521.3■■□□□ 11e-6■■■■■ 41.2
DKC1O60832 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.91e-6■■■■■ 41.2
DKC1O60832 SLC26A11-216ENST00000576126 472 ntTSL 318.66■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 41.2
DKC1O60832 SLC26A11-205ENST00000571176 845 ntTSL 317.53■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 41.2
DKC1O60832 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 41.2
DKC1O60832 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 41.2
DKC1O60832 SLC26A11-209ENST00000571888 537 ntTSL 416.19■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 41.2
DKC1O60832 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 41.2
DKC1O60832 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.357e-7■■■■■ 41.1
DKC1O60832 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.737e-7■■■■■ 41.1
DKC1O60832 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.037e-7■■■■■ 41.1
DKC1O60832 MAX-215ENST00000556892 474 ntTSL 522.65■■□□□ 1.221e-6■■■■■ 41
DKC1O60832 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.181e-6■■■■■ 41
DKC1O60832 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 41
DKC1O60832 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 41
DKC1O60832 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 41
DKC1O60832 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 41
DKC1O60832 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 41
DKC1O60832 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 41
DKC1O60832 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 41
DKC1O60832 MAX-216ENST00000556979 615 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 41
DKC1O60832 MAX-214ENST00000556702 520 ntTSL 213.62□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 41
DKC1O60832 MAX-209ENST00000554709 327 ntTSL 413.61□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 41
DKC1O60832 MAX-206ENST00000394606 2097 ntTSL 1 (best)13.22□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 41
DKC1O60832 MAX-202ENST00000284165 3155 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.51e-6■■■■■ 41
DKC1O60832 MAX-213ENST00000556443 585 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 41
DKC1O60832 CTIF-205ENST00000587860 2940 ntTSL 215.9■□□□□ 0.147e-8■■■■■ 40.9
DKC1O60832 C7orf50-205ENST00000444428 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.17■□□□□ 0.343e-7■■■■■ 40.8
DKC1O60832 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.441e-323■■■■■ 40.8
DKC1O60832 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.391e-323■■■■■ 40.8
DKC1O60832 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.051e-323■■■■■ 40.8
DKC1O60832 EEF1B2-205ENST00000429769 912 ntTSL 512.29□□□□□ -0.441e-323■■■■■ 40.8
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