Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms