Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT87PA6NCN2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms