Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHB6Q9Y5E3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHB6Q9Y5E3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHB6Q9Y5E3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHB6Q9Y5E3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHB6Q9Y5E3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHB6Q9Y5E3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHB6Q9Y5E3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHB6Q9Y5E3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHB6Q9Y5E3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHB6Q9Y5E3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PCDHB6Q9Y5E3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCDHB6Q9Y5E3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PCDHB6Q9Y5E3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PCDHB6Q9Y5E3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PCDHB6Q9Y5E3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDHB6Q9Y5E3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDHB6Q9Y5E3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDHB6Q9Y5E3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDHB6Q9Y5E3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms