Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXND1Q9Y4D7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.4 ms