Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2B5

VPS9D1, VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1Q9Y2B5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS9D1Q9Y2B5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
VPS9D1Q9Y2B5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms