Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PCDHA12Q9UN75 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms