Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI09

NDUFA12, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA12Q9UI09 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA12Q9UI09 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms