Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.034e-21■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.028e-7■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -04e-21■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 ELAC2-210ENST00000491478 758 ntTSL 515.02■□□□□ -04e-21■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 ELAC2-208ENST00000484122 3738 ntTSL 214.84□□□□□ -0.034e-21■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 AC020915.1-204ENST00000434052 616 ntTSL 214.79□□□□□ -0.044e-21■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 AC020915.1-205ENST00000608070 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.78□□□□□ -0.044e-21■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 PLEKHB2-209ENST00000482225 644 ntTSL 214.63□□□□□ -0.074e-21■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 CCDC138-202ENST00000409529 2364 ntTSL 214.32□□□□□ -0.128e-7■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.124e-21■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 CCDC138-201ENST00000295124 2383 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.198e-7■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 PLEKHB2-208ENST00000439822 4177 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.294e-21■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 TBC1D14-201ENST00000409757 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 CASKIN1-203ENST00000564289 193 ntTSL 312.84□□□□□ -0.351e-31■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 TBC1D14-207ENST00000448507 4887 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 ELAC2-211ENST00000492559 615 ntTSL 411.62□□□□□ -0.554e-21■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 PLEKHB2-201ENST00000234115 4208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.624e-21■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 KAT2A-204ENST00000588759 404 ntTSL 510□□□□□ -0.814e-21■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 SORBS1-204ENST00000361941 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.871e-31■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 SORBS1-201ENST00000277982 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.881e-31■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.94e-8■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 SORBS1-208ENST00000371241 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.981e-31■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 SORBS1-218ENST00000492542 720 ntTSL 38.89□□□□□ -0.991e-31■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 SORBS1-209ENST00000371245 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -11e-31■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.031e-31■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 SLTM-223ENST00000560532 559 ntTSL 48.4□□□□□ -1.068e-41■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 SORBS1-207ENST00000371239 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.141e-31■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 SLTM-213ENST00000557950 924 ntTSL 37.51□□□□□ -1.218e-41■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 DCHS2-202ENST00000357232 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)7.36□□□□□ -1.234e-8■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 SF3A3-202ENST00000460925 793 ntTSL 27.17□□□□□ -1.264e-21■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.836e-9■■■■■ 390.8
UTP3Q9NQZ2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.616e-9■■■■■ 390.8
UTP3Q9NQZ2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.486e-9■■■■■ 390.8
UTP3Q9NQZ2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.486e-9■■■■■ 390.8
UTP3Q9NQZ2 SLC29A2-203ENST00000540386 2474 ntTSL 1 (best)17.16■□□□□ 0.346e-9■■■■■ 390.8
UTP3Q9NQZ2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.256e-9■■■■■ 390.8
UTP3Q9NQZ2 ATXN2L-217ENST00000565845 750 ntTSL 518.77■□□□□ 0.68e-7■■■■■ 388.5
UTP3Q9NQZ2 TAF5L-203ENST00000366675 4062 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.35e-37■■■■■ 388.2
UTP3Q9NQZ2 SLC8B1-205ENST00000548518 664 ntTSL 412.82□□□□□ -0.366e-19■■■■■ 387
UTP3Q9NQZ2 SLC8B1-208ENST00000549372 555 ntTSL 59.33□□□□□ -0.926e-19■■■■■ 387
UTP3Q9NQZ2 PTGS1-204ENST00000426608 468 ntTSL 514.15□□□□□ -0.145e-10■■■■■ 385.9
UTP3Q9NQZ2 PTGS1-201ENST00000223423 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.245e-10■■■■■ 385.9
UTP3Q9NQZ2 PTGS1-202ENST00000362012 4964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.455e-10■■■■■ 385.9
UTP3Q9NQZ2 PTGS1-206ENST00000614910 4894 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.475e-10■■■■■ 385.9
UTP3Q9NQZ2 PTGS1-207ENST00000619306 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.525e-10■■■■■ 385.9
UTP3Q9NQZ2 PTGS1-205ENST00000540753 5375 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.535e-10■■■■■ 385.9
UTP3Q9NQZ2 CHMP6-202ENST00000571457 552 ntTSL 312.03□□□□□ -0.482e-8■■■■■ 385.8
UTP3Q9NQZ2 CDK12-205ENST00000559663 871 ntTSL 58.59□□□□□ -1.032e-9■■■■■ 385.6
UTP3Q9NQZ2 CTNNA1-213ENST00000519113 859 ntTSL 320.05■□□□□ 0.85e-46■■■■■ 385.1
UTP3Q9NQZ2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.699e-7■■■■■ 385.1
UTP3Q9NQZ2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.689e-7■■■■■ 385.1
UTP3Q9NQZ2 LZTR1-205ENST00000439171 635 ntTSL 516.04■□□□□ 0.162e-11■■■■■ 385.1
UTP3Q9NQZ2 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 09e-7■■■■■ 385.1
UTP3Q9NQZ2 LZTR1-209ENST00000463909 3505 ntTSL 1 (best)13.62□□□□□ -0.232e-11■■■■■ 385.1
UTP3Q9NQZ2 CTNNA1-211ENST00000518910 572 ntTSL 413.31□□□□□ -0.285e-46■■■■■ 385.1
UTP3Q9NQZ2 LZTR1-207ENST00000452988 878 ntTSL 313□□□□□ -0.332e-11■■■■■ 385.1
UTP3Q9NQZ2 LZTR1-218ENST00000498649 1044 ntTSL 313□□□□□ -0.332e-11■■■■■ 385.1
UTP3Q9NQZ2 CTNNA1-240ENST00000523912 545 ntTSL 49.36□□□□□ -0.915e-46■■■■■ 385.1
UTP3Q9NQZ2 CTNNA1-215ENST00000519309 869 ntTSL 38.89□□□□□ -0.995e-46■■■■■ 385.1
UTP3Q9NQZ2 CTNNA1-219ENST00000520158 719 ntTSL 36.38□□□□□ -1.395e-46■■■■■ 385.1
UTP3Q9NQZ2 CTNNA1-209ENST00000518585 568 ntTSL 46.07□□□□□ -1.445e-46■■■■■ 385.1
UTP3Q9NQZ2 SCFD2-203ENST00000503450 529 ntTSL 45.57□□□□□ -1.522e-8■■■■■ 385.1
UTP3Q9NQZ2 FOXP1-203ENST00000327590 5685 ntTSL 29.19□□□□□ -0.942e-9■■■■■ 384.7
UTP3Q9NQZ2 LINC01572-201ENST00000561611 2194 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.888e-12■■■■■ 384.6
UTP3Q9NQZ2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.342e-25■■■■■ 384.6
UTP3Q9NQZ2 SLC26A11-206ENST00000571215 591 ntTSL 419.99■□□□□ 0.792e-25■■■■■ 384.6
UTP3Q9NQZ2 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 383.8
UTP3Q9NQZ2 C7orf55-LUC7L2-201ENST00000541515 1661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.761e-6■■■■■ 383.8
UTP3Q9NQZ2 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.061e-8■■■■■ 382.9
UTP3Q9NQZ2 INTS7-201ENST00000366992 3380 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.862e-6■■■■■ 382.7
UTP3Q9NQZ2 INTS7-202ENST00000366993 3422 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.072e-6■■■■■ 382.7
UTP3Q9NQZ2 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.122e-6■■■■■ 382.7
UTP3Q9NQZ2 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.162e-6■■■■■ 382.7
UTP3Q9NQZ2 INTS7-208ENST00000469606 4447 ntTSL 1 (best)7.65□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 382.7
UTP3Q9NQZ2 WWP2-216ENST00000569174 2474 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.764e-7■■■■■ 382.7
UTP3Q9NQZ2 TSKU-204ENST00000533752 643 ntTSL 416.84■□□□□ 0.295e-13■■■■■ 382
UTP3Q9NQZ2 KDM4C-205ENST00000428870 3039 ntTSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.14e-8■■■■■ 381.1
UTP3Q9NQZ2 SEPT9-235ENST00000591020 582 ntTSL 411.87□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 381.1
UTP3Q9NQZ2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.511e-6■■■■■ 380.9
UTP3Q9NQZ2 MAST3-203ENST00000608648 1760 ntTSL 521.67■■□□□ 1.066e-7■■■■■ 379.8
UTP3Q9NQZ2 ADD3-218ENST00000495661 557 ntTSL 513.02□□□□□ -0.335e-14■■■■■ 378.9
UTP3Q9NQZ2 ADD3-204ENST00000459738 229 ntTSL 213.02□□□□□ -0.335e-14■■■■■ 378.9
UTP3Q9NQZ2 ADD3-213ENST00000487085 708 ntTSL 312.69□□□□□ -0.385e-14■■■■■ 378.9
UTP3Q9NQZ2 ADD3-211ENST00000484622 401 ntTSL 512.69□□□□□ -0.385e-14■■■■■ 378.9
UTP3Q9NQZ2 ADD3-209ENST00000475954 449 ntTSL 28.56□□□□□ -1.045e-14■■■■■ 378.9
UTP3Q9NQZ2 ADD3-219ENST00000496517 762 ntTSL 58.56□□□□□ -1.045e-14■■■■■ 378.9
UTP3Q9NQZ2 ADD3-220ENST00000497125 763 ntTSL 36.48□□□□□ -1.375e-14■■■■■ 378.9
UTP3Q9NQZ2 ADD3-205ENST00000468251 697 ntTSL 55.45□□□□□ -1.545e-14■■■■■ 378.9
UTP3Q9NQZ2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.637e-11■■■■■ 378.8
UTP3Q9NQZ2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.971e-6■■■■■ 378
UTP3Q9NQZ2 PFKFB3-203ENST00000379775 4483 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 378
UTP3Q9NQZ2 AL121845.2-202ENST00000476221 446 ntTSL 518.99■□□□□ 0.634e-7■■■■■ 377.3
UTP3Q9NQZ2 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.174e-7■■■■■ 377.3
UTP3Q9NQZ2 STRN4-220ENST00000600710 565 ntTSL 514.82□□□□□ -0.042e-9■■■■■ 377.1
UTP3Q9NQZ2 STRN4-212ENST00000596012 560 ntTSL 414.17□□□□□ -0.142e-9■■■■■ 377.1
UTP3Q9NQZ2 LEMD3-203ENST00000541171 856 ntTSL 225.4■■□□□ 1.668e-7■■■■■ 376.6
UTP3Q9NQZ2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.368e-7■■■■■ 376.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF707-226ENST00000533031 2114 ntTSL 224.04■■□□□ 1.442e-12■■■■■ 375.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.322e-12■■■■■ 375.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.132e-12■■■■■ 375.8
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