Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCG8

CWC22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC22Q9HCG8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CWC22Q9HCG8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CWC22Q9HCG8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms