Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.2 ms