Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MRRFQ96E11 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1836.7 ms