Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GCC1Q96CN9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms