Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms