Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAE3

LINC01555, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01555, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01555Q8NAE3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINC01555Q8NAE3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms