Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf62Q8N4C0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf62Q8N4C0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf62Q8N4C0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf62Q8N4C0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf62Q8N4C0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf62Q8N4C0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf62Q8N4C0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf62Q8N4C0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf62Q8N4C0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf62Q8N4C0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf62Q8N4C0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf62Q8N4C0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf62Q8N4C0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf62Q8N4C0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf62Q8N4C0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf62Q8N4C0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf62Q8N4C0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf62Q8N4C0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf62Q8N4C0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf62Q8N4C0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf62Q8N4C0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf62Q8N4C0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf62Q8N4C0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf62Q8N4C0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf62Q8N4C0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf62Q8N4C0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf62Q8N4C0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
C9orf62Q8N4C0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C9orf62Q8N4C0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C9orf62Q8N4C0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf62Q8N4C0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C9orf62Q8N4C0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C9orf62Q8N4C0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf62Q8N4C0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf62Q8N4C0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms