Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HACE1Q8IYU2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms