Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC11Q7Z392 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms