Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNI2Q6ZMN8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 674.4 ms