Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRRT3Q5FWE3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRRT3Q5FWE3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRRT3Q5FWE3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRRT3Q5FWE3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRRT3Q5FWE3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRRT3Q5FWE3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRRT3Q5FWE3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRRT3Q5FWE3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRRT3Q5FWE3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRRT3Q5FWE3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRRT3Q5FWE3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRRT3Q5FWE3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRRT3Q5FWE3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRRT3Q5FWE3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRRT3Q5FWE3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRRT3Q5FWE3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRRT3Q5FWE3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRRT3Q5FWE3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRRT3Q5FWE3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRRT3Q5FWE3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRRT3Q5FWE3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRRT3Q5FWE3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRRT3Q5FWE3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRRT3Q5FWE3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRRT3Q5FWE3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms