Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC27Q2M243 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms