Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRCAPQ14761 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRCAPQ14761 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRCAPQ14761 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRCAPQ14761 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRCAPQ14761 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRCAPQ14761 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRCAPQ14761 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRCAPQ14761 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRCAPQ14761 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCAPQ14761 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCAPQ14761 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCAPQ14761 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCAPQ14761 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCAPQ14761 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCAPQ14761 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCAPQ14761 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCAPQ14761 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCAPQ14761 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCAPQ14761 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCAPQ14761 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCAPQ14761 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCAPQ14761 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRCAPQ14761 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRCAPQ14761 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRCAPQ14761 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRCAPQ14761 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms