Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPRL3Q12980 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPRL3Q12980 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NPRL3Q12980 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NPRL3Q12980 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NPRL3Q12980 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPRL3Q12980 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPRL3Q12980 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NPRL3Q12980 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
NPRL3Q12980 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPRL3Q12980 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPRL3Q12980 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPRL3Q12980 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NPRL3Q12980 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NPRL3Q12980 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NPRL3Q12980 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPRL3Q12980 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NPRL3Q12980 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NPRL3Q12980 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPRL3Q12980 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPRL3Q12980 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NPRL3Q12980 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms