Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.37□□□□□ -1.55
HER1Q12276 HXT5YHR096C 1779 nt5.37□□□□□ -1.55
HER1Q12276 GIP1YBR045C 1920 nt5.36□□□□□ -1.55
HER1Q12276 YML082WYML082W 1950 nt5.36□□□□□ -1.55
HER1Q12276 YDR109CYDR109C 2148 nt5.36□□□□□ -1.55
HER1Q12276 RSM10YDR041W 612 nt5.36□□□□□ -1.55
HER1Q12276 MSA2YKR077W 1092 nt5.36□□□□□ -1.55
HER1Q12276 YLR311CYLR311C 348 nt5.36□□□□□ -1.55
HER1Q12276 YET2YMR040W 483 nt5.36□□□□□ -1.55
HER1Q12276 SSZ1YHR064C 1617 nt5.36□□□□□ -1.55
HER1Q12276 APE3YBR286W 1614 nt5.36□□□□□ -1.55
HER1Q12276 PMA1YGL008C 2757 nt5.36□□□□□ -1.55
HER1Q12276 ACC1YNR016C 6702 nt5.35□□□□□ -1.55
HER1Q12276 BSC5YNR069C 1470 nt5.35□□□□□ -1.55
HER1Q12276 RPT4YOR259C 1314 nt5.35□□□□□ -1.55
HER1Q12276 HMLALPHA1YCL066W 528 nt5.35□□□□□ -1.55
HER1Q12276 MATALPHA1YCR040W 528 nt5.35□□□□□ -1.55
HER1Q12276 YGR291CYGR291C 222 nt5.35□□□□□ -1.55
HER1Q12276 LEU5YHR002W 1074 nt5.35□□□□□ -1.55
HER1Q12276 REX3YLR107W 1215 nt5.35□□□□□ -1.55
HER1Q12276 YLR126CYLR126C 756 nt5.35□□□□□ -1.55
HER1Q12276 MED4YOR174W 855 nt5.35□□□□□ -1.55
HER1Q12276 HEM15YOR176W 1182 nt5.35□□□□□ -1.55
HER1Q12276 ALG5YPL227C 1005 nt5.35□□□□□ -1.55
HER1Q12276 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt5.35□□□□□ -1.55
HER1Q12276 PRT1YOR361C 2292 nt5.35□□□□□ -1.55
HER1Q12276 YEF1YEL041W 1488 nt5.34□□□□□ -1.55
HER1Q12276 YEA6YEL006W 1008 nt5.34□□□□□ -1.55
HER1Q12276 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.34□□□□□ -1.55
HER1Q12276 YKR041WYKR041W 753 nt5.34□□□□□ -1.55
HER1Q12276 MTQ1YNL063W 945 nt5.34□□□□□ -1.55
HER1Q12276 GLE1YDL207W 1617 nt5.34□□□□□ -1.56
HER1Q12276 MUM3YOR298W 1440 nt5.33□□□□□ -1.56
HER1Q12276 ADE12YNL220W 1302 nt5.33□□□□□ -1.56
HER1Q12276 ARB1YER036C 1833 nt5.33□□□□□ -1.56
HER1Q12276 YCR006CYCR006C 474 nt5.33□□□□□ -1.56
HER1Q12276 EDC1YGL222C 528 nt5.33□□□□□ -1.56
HER1Q12276 NQM1YGR043C 1002 nt5.33□□□□□ -1.56
HER1Q12276 YKR075CYKR075C 924 nt5.33□□□□□ -1.56
HER1Q12276 HCR1YLR192C 798 nt5.33□□□□□ -1.56
HER1Q12276 CIN4YMR138W 576 nt5.33□□□□□ -1.56
HER1Q12276 ARR1YPR199C 885 nt5.33□□□□□ -1.56
HER1Q12276 AMD1YML035C 2433 nt5.33□□□□□ -1.56
HER1Q12276 UBA1YKL210W 3075 nt5.32□□□□□ -1.56
HER1Q12276 YME1YPR024W 2244 nt5.32□□□□□ -1.56
HER1Q12276 VPS1YKR001C 2115 nt5.32□□□□□ -1.56
HER1Q12276 YJR124CYJR124C 1347 nt5.32□□□□□ -1.56
HER1Q12276 GLO2YDR272W 825 nt5.32□□□□□ -1.56
HER1Q12276 ATO3YDR384C 828 nt5.32□□□□□ -1.56
HER1Q12276 YER010CYER010C 705 nt5.32□□□□□ -1.56
HER1Q12276 GON7YJL184W 372 nt5.32□□□□□ -1.56
HER1Q12276 YLR283WYLR283W 945 nt5.32□□□□□ -1.56
HER1Q12276 MTF1YMR228W 1026 nt5.32□□□□□ -1.56
HER1Q12276 PRI2YKL045W 1587 nt5.32□□□□□ -1.56
HER1Q12276 GCR2YNL199C 1605 nt5.31□□□□□ -1.56
HER1Q12276 RPN5YDL147W 1338 nt5.31□□□□□ -1.56
HER1Q12276 ADD66YKL206C 804 nt5.31□□□□□ -1.56
HER1Q12276 POS5YPL188W 1245 nt5.31□□□□□ -1.56
HER1Q12276 SIP5YMR140W 1470 nt5.31□□□□□ -1.56
HER1Q12276 VRP1YLR337C 2454 nt5.31□□□□□ -1.56
HER1Q12276 BAP2YBR068C 1830 nt5.3□□□□□ -1.56
HER1Q12276 RSC30YHR056C 2652 nt5.3□□□□□ -1.56
HER1Q12276 AI3Q0060 1248 nt5.3□□□□□ -1.56
HER1Q12276 PRS2YER099C 957 nt5.3□□□□□ -1.56
HER1Q12276 MRF1YGL143C 1242 nt5.3□□□□□ -1.56
HER1Q12276 CDC43YGL155W 1131 nt5.3□□□□□ -1.56
HER1Q12276 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt5.3□□□□□ -1.56
HER1Q12276 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.3□□□□□ -1.56
HER1Q12276 NMD4YLR363C 657 nt5.3□□□□□ -1.56
HER1Q12276 NRM1YNR009W 750 nt5.3□□□□□ -1.56
HER1Q12276 MRPS5YBR251W 924 nt5.3□□□□□ -1.56
HER1Q12276 HXT3YDR345C 1704 nt5.3□□□□□ -1.56
HER1Q12276 SSY5YJL156C 2100 nt5.3□□□□□ -1.56
HER1Q12276 ARN2YHL047C 1863 nt5.3□□□□□ -1.56
HER1Q12276 SAS4YDR181C 1446 nt5.3□□□□□ -1.56
HER1Q12276 MEC3YLR288C 1425 nt5.3□□□□□ -1.56
HER1Q12276 YPL245WYPL245W 1365 nt5.29□□□□□ -1.56
HER1Q12276 FRE3YOR381W 2136 nt5.29□□□□□ -1.56
HER1Q12276 MNS1YJR131W 1650 nt5.29□□□□□ -1.56
HER1Q12276 MAF1YDR005C 1188 nt5.29□□□□□ -1.56
HER1Q12276 RTT103YDR289C 1230 nt5.29□□□□□ -1.56
HER1Q12276 YJR056CYJR056C 711 nt5.29□□□□□ -1.56
HER1Q12276 UTP18YJL069C 1785 nt5.29□□□□□ -1.56
HER1Q12276 RRN3YKL125W 1884 nt5.28□□□□□ -1.56
HER1Q12276 LCB2YDR062W 1686 nt5.28□□□□□ -1.56
HER1Q12276 KCH1YJR054W 1494 nt5.28□□□□□ -1.56
HER1Q12276 HFI1YPL254W 1467 nt5.28□□□□□ -1.56
HER1Q12276 HST4YDR191W 1113 nt5.28□□□□□ -1.56
HER1Q12276 AME1YBR211C 975 nt5.28□□□□□ -1.56
HER1Q12276 FRE7YOL152W 1863 nt5.28□□□□□ -1.56
HER1Q12276 HAP1YLR256W 4509 nt5.27□□□□□ -1.57
HER1Q12276 STE12YHR084W 2067 nt5.27□□□□□ -1.57
HER1Q12276 SPO12YHR152W 522 nt5.27□□□□□ -1.57
HER1Q12276 YIR043CYIR043C 693 nt5.27□□□□□ -1.57
HER1Q12276 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt5.27□□□□□ -1.57
HER1Q12276 RPT1YKL145W 1404 nt5.27□□□□□ -1.57
HER1Q12276 SMF3YLR034C 1422 nt5.27□□□□□ -1.57
HER1Q12276 UBC12YLR306W 567 nt5.27□□□□□ -1.57
HER1Q12276 YBL044WYBL044W 369 nt5.27□□□□□ -1.57
HER1Q12276 RFA2YNL312W 822 nt5.27□□□□□ -1.57
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