Protein–RNA interactions for Protein: Q08972

NEW1, [NU+] prion formation protein 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEW1Q08972 CDC43YGL155W 1131 nt5.92□□□□□ -1.46
NEW1Q08972 GEP5YLR091W 882 nt5.92□□□□□ -1.46
NEW1Q08972 MRP51YPL118W 1035 nt5.92□□□□□ -1.46
NEW1Q08972 GCR2YNL199C 1605 nt5.92□□□□□ -1.46
NEW1Q08972 VMA13YPR036W 1437 nt5.91□□□□□ -1.46
NEW1Q08972 PIF1YML061C 2580 nt5.91□□□□□ -1.46
NEW1Q08972 ISY1YJR050W 708 nt5.91□□□□□ -1.46
NEW1Q08972 YPL071CYPL071C 471 nt5.91□□□□□ -1.46
NEW1Q08972 YPR195CYPR195C 330 nt5.91□□□□□ -1.46
NEW1Q08972 CLD1YGR110W 1338 nt5.91□□□□□ -1.46
NEW1Q08972 YMD8YML038C 1329 nt5.91□□□□□ -1.46
NEW1Q08972 SSZ1YHR064C 1617 nt5.91□□□□□ -1.46
NEW1Q08972 PDC1YLR044C 1692 nt5.91□□□□□ -1.46
NEW1Q08972 SMF3YLR034C 1422 nt5.91□□□□□ -1.46
NEW1Q08972 HFI1YPL254W 1467 nt5.9□□□□□ -1.46
NEW1Q08972 ARP10YDR106W 855 nt5.9□□□□□ -1.46
NEW1Q08972 YDR154CYDR154C 351 nt5.9□□□□□ -1.46
NEW1Q08972 SNM1YDR478W 597 nt5.9□□□□□ -1.46
NEW1Q08972 FMP48YGR052W 1110 nt5.9□□□□□ -1.46
NEW1Q08972 SEN34YAR008W 828 nt5.9□□□□□ -1.46
NEW1Q08972 YPL014WYPL014W 1146 nt5.9□□□□□ -1.46
NEW1Q08972 ABZ1YNR033W 2364 nt5.9□□□□□ -1.46
NEW1Q08972 YJR124CYJR124C 1347 nt5.9□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 ATG1YGL180W 2694 nt5.9□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 STE13YOR219C 2796 nt5.89□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 CWC21YDR482C 408 nt5.89□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 VMA16YHR026W 642 nt5.89□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 ACF2YLR144C 2340 nt5.89□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 FOL1YNL256W 2475 nt5.89□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 YEL028WYEL028W 462 nt5.88□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 CTR2YHR175W 570 nt5.88□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 MND2YIR025W 1107 nt5.88□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.88□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 YAP1801YHR161C 1914 nt5.87□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 FLC3YGL139W 2409 nt5.87□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 CLA4YNL298W 2529 nt5.87□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 UBC6YER100W 753 nt5.87□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.87□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 YKR041WYKR041W 753 nt5.87□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 YML101C-AYML101C-A 318 nt5.87□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 SNT2YGL131C 4212 nt5.87□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 HRP1YOL123W 1605 nt5.87□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 TUL1YKL034W 2277 nt5.87□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 DED81YHR019C 1665 nt5.86□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 IMG2YCR071C 441 nt5.86□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 YDL034WYDL034W 345 nt5.86□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 MRPL4YLR439W 960 nt5.86□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 SHP1YBL058W 1272 nt5.86□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 PIN2YOR104W 849 nt5.86□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 PMA1YGL008C 2757 nt5.86□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 VAN1YML115C 1608 nt5.85□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 VTC2YFL004W 2487 nt5.85□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 SPO77YLR341W 1434 nt5.85□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 COX26YDR119W-A 201 nt5.85□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 SKI8YGL213C 1194 nt5.85□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.85□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.85□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.85□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.85□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.85□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.85□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.85□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.85□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.85□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.85□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 YGR176WYGR176W 348 nt5.85□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 IPI1YHR085W 1005 nt5.85□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 SEC13YLR208W 894 nt5.85□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 SPG4YMR107W 348 nt5.85□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 SNO4YMR322C 714 nt5.85□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 LST8YNL006W 912 nt5.85□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 NOP13YNL175C 1212 nt5.85□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 HSP33YOR391C 714 nt5.85□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 YPL113CYPL113C 1191 nt5.85□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 HSP32YPL280W 714 nt5.85□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 UBC4YBR082C 447 nt5.85□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.85□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 DPH2YKL191W 1605 nt5.85□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 ATG32YIL146C 1590 nt5.84□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 GAS3YMR215W 1575 nt5.84□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 ICE2YIL090W 1476 nt5.84□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 ERI1YPL096C-A 207 nt5.84□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 BRF1YGR246C 1791 nt5.84□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 YHR045WYHR045W 1683 nt5.84□□□□□ -1.47
NEW1Q08972 MAD3YJL013C 1548 nt5.84□□□□□ -1.48
NEW1Q08972 ALT1YLR089C 1779 nt5.83□□□□□ -1.48
NEW1Q08972 YGR011WYGR011W 327 nt5.83□□□□□ -1.48
NEW1Q08972 YLL059CYLL059C 507 nt5.83□□□□□ -1.48
NEW1Q08972 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt5.83□□□□□ -1.48
NEW1Q08972 ARR3YPR201W 1215 nt5.83□□□□□ -1.48
NEW1Q08972 SDA1YGR245C 2304 nt5.83□□□□□ -1.48
NEW1Q08972 GSH2YOL049W 1476 nt5.83□□□□□ -1.48
NEW1Q08972 MNN2YBR015C 1794 nt5.83□□□□□ -1.48
NEW1Q08972 RNR3YIL066C 2610 nt5.82□□□□□ -1.48
NEW1Q08972 DXO1YDR370C 1329 nt5.82□□□□□ -1.48
NEW1Q08972 RPT4YOR259C 1314 nt5.82□□□□□ -1.48
NEW1Q08972 SIA1YOR137C 1869 nt5.82□□□□□ -1.48
NEW1Q08972 YDL121CYDL121C 450 nt5.82□□□□□ -1.48
NEW1Q08972 GCS1YDL226C 1059 nt5.82□□□□□ -1.48
NEW1Q08972 URA3YEL021W 804 nt5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.7 ms