Protein–RNA interactions for Protein: P89113

DDR2, Protein DDR2, yeast

Predictions only

Length 61 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	P89113	snR17b	snR17b	332 nt		3.29	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	CDC28	YBR160W	897 nt		3.29	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	GCN20	YFR009W	2259 nt		3.29	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	BUD22	YMR014W	1560 nt		3.29	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	APJ1	YNL077W	1587 nt		3.29	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	MSH1	YHR120W	2880 nt		3.29	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	STE20	YHL007C	2820 nt		3.29	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	BRL1	YHR036W	1416 nt		3.28	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	YFR035C	YFR035C	345 nt		3.28	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	CKA2	YOR061W	1020 nt		3.28	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	PHO90	YJL198W	2646 nt		3.28	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	TIM54	YJL054W	1437 nt		3.27	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	TFC6	YDR362C	2019 nt		3.27	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	NOC4	YPR144C	1659 nt		3.27	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	CBK1	YNL161W	2271 nt		3.27	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	TDA7	YNL176C	1911 nt		3.27	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	EMP46	YLR080W	1335 nt		3.27	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	YDR417C	YDR417C	372 nt		3.27	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	YEL067C	YEL067C	588 nt		3.27	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	GRX4	YER174C	735 nt		3.27	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	RPB4	YJL140W	666 nt		3.27	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	MIM2	YLR099W-A	264 nt		3.27	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	HLJ1	YMR161W	675 nt		3.27	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	YJL206C	YJL206C	2277 nt		3.27	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	YNL095C	YNL095C	1929 nt		3.27	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	IMD3	YLR432W	1572 nt		3.26	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	MTF2	YDL044C	1323 nt		3.26	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	SLO1	YER180C-A	258 nt		3.26	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	FHN1	YGR131W	525 nt		3.26	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	IPI1	YHR085W	1005 nt		3.26	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	EFM4	YIL064W	774 nt		3.26	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	TRM10	YOL093W	882 nt		3.26	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	KRE6	YPR159W	2163 nt		3.26	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	CAF4	YKR036C	1932 nt		3.26	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	CRT10	YOL063C	2874 nt		3.26	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	ADE6	YGR061C	4077 nt		3.25	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	APC1	YNL172W	5247 nt		3.25	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	AXL2	YIL140W	2472 nt		3.25	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	CLF1	YLR117C	2064 nt		3.25	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	THI5	YFL058W	1023 nt		3.25	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	SEH1	YGL100W	1050 nt		3.25	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	YKL151C	YKL151C	1014 nt		3.25	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	THI12	YNL332W	1023 nt		3.25	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	TLG2	YOL018C	1194 nt		3.25	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	YCL012C	YCL012C	405 nt		3.25	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	THI21	YPL258C	1656 nt		3.24	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	YMR102C	YMR102C	2505 nt		3.24	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	GET3	YDL100C	1065 nt		3.24	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	NPY1	YGL067W	1155 nt		3.24	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	ERP5	YHR110W	639 nt		3.24	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	NSG1	YHR133C	876 nt		3.24	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	YKL023W	YKL023W	834 nt		3.24	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	MTC2	YKL098W	1074 nt		3.24	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	NDC1	YML031W	1968 nt		3.23	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	RSC2	YLR357W	2670 nt		3.23	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	YGR182C	YGR182C	354 nt		3.23	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	TEF4	YKL081W	1239 nt		3.23	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	ARG1	YOL058W	1263 nt		3.23	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	YTA6	YPL074W	2265 nt		3.23	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	MNT2	YGL257C	1677 nt		3.23	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	YJR124C	YJR124C	1347 nt		3.22	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	TFC7	YOR110W	1308 nt		3.22	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	ADY2	YCR010C	852 nt		3.22	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	TFB3	YDR460W	966 nt		3.22	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	YEL045C	YEL045C	426 nt		3.22	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	SYN8	YAL014C	768 nt		3.22	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	YJL171C	YJL171C	1191 nt		3.22	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	MAP2	YBL091C	1266 nt		3.22	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	TRS33	YOR115C	807 nt		3.22	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	SAM4	YPL273W	978 nt		3.22	□□□□□ -1.89
DDR2	P89113	HXT5	YHR096C	1779 nt		3.21	□□□□□ -1.9
DDR2	P89113	YHR182W	YHR182W	2358 nt		3.21	□□□□□ -1.9
DDR2	P89113	YGL185C	YGL185C	1140 nt		3.21	□□□□□ -1.9
DDR2	P89113	YGR035W-A	YGR035W-A	222 nt		3.21	□□□□□ -1.9
DDR2	P89113	SYF2	YGR129W	648 nt		3.21	□□□□□ -1.9
DDR2	P89113	YJR085C	YJR085C	318 nt		3.21	□□□□□ -1.9
DDR2	P89113	YLR194C	YLR194C	765 nt		3.21	□□□□□ -1.9
DDR2	P89113	COG5	YNL051W	1212 nt		3.21	□□□□□ -1.9
DDR2	P89113	YOR318C	YOR318C	306 nt		3.21	□□□□□ -1.9
DDR2	P89113	NOB1	YOR056C	1380 nt		3.21	□□□□□ -1.9
DDR2	P89113	HXT4	YHR092C	1731 nt		3.21	□□□□□ -1.9
DDR2	P89113	PGM2	YMR105C	1710 nt		3.21	□□□□□ -1.9
DDR2	P89113	AAP1	YHR047C	2571 nt		3.2	□□□□□ -1.9
DDR2	P89113	YDL172C	YDL172C	480 nt		3.2	□□□□□ -1.9
DDR2	P89113	RPT6	YGL048C	1218 nt		3.2	□□□□□ -1.9
DDR2	P89113	YGR153W	YGR153W	654 nt		3.2	□□□□□ -1.9
DDR2	P89113	UGA2	YBR006W	1494 nt		3.2	□□□□□ -1.9
DDR2	P89113	MPA43	YNL249C	1629 nt		3.19	□□□□□ -1.9
DDR2	P89113	YIL067C	YIL067C	2037 nt		3.19	□□□□□ -1.9
DDR2	P89113	MPS3	YJL019W	2049 nt		3.19	□□□□□ -1.9
DDR2	P89113	RHB1	YCR027C	630 nt		3.19	□□□□□ -1.9
DDR2	P89113	PHM8	YER037W	966 nt		3.19	□□□□□ -1.9
DDR2	P89113	YFR052C-A	YFR052C-A	306 nt		3.19	□□□□□ -1.9
DDR2	P89113	RMR1	YGL250W	726 nt		3.19	□□□□□ -1.9
DDR2	P89113	ECT1	YGR007W	972 nt		3.19	□□□□□ -1.9
DDR2	P89113	YNL174W	YNL174W	573 nt		3.19	□□□□□ -1.9
DDR2	P89113	MRL1	YPR079W	1146 nt		3.19	□□□□□ -1.9
DDR2	P89113	IMA1	YGR287C	1770 nt		3.19	□□□□□ -1.9
DDR2	P89113	SOG2	YOR353C	2376 nt		3.19	□□□□□ -1.9
DDR2	P89113	FRS1	YLR060W	1788 nt		3.18	□□□□□ -1.9

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