Protein–RNA interactions for Protein: P38789

SSF1, Ribosome biogenesis protein SSF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF1P38789 RAD7YJR052W 1698 nt7.3□□□□□ -1.24
SSF1P38789 KAR5YMR065W 1515 nt7.3□□□□□ -1.24
SSF1P38789 YCK1YHR135C 1617 nt7.3□□□□□ -1.24
SSF1P38789 YOR389WYOR389W 1875 nt7.3□□□□□ -1.24
SSF1P38789 DEG1YFL001W 1329 nt7.29□□□□□ -1.24
SSF1P38789 CIR1YGR207C 786 nt7.29□□□□□ -1.24
SSF1P38789 YIR042CYIR042C 711 nt7.29□□□□□ -1.24
SSF1P38789 TSA1YML028W 591 nt7.29□□□□□ -1.24
SSF1P38789 SET5YHR207C 1581 nt7.29□□□□□ -1.24
SSF1P38789 PRR2YDL214C 2100 nt7.28□□□□□ -1.24
SSF1P38789 SSK1YLR006C 2139 nt7.28□□□□□ -1.24
SSF1P38789 PRT1YOR361C 2292 nt7.28□□□□□ -1.24
SSF1P38789 IPK1YDR315C 846 nt7.28□□□□□ -1.24
SSF1P38789 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt7.28□□□□□ -1.24
SSF1P38789 YPL073CYPL073C 486 nt7.28□□□□□ -1.24
SSF1P38789 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt7.28□□□□□ -1.24
SSF1P38789 NRG2YBR066C 663 nt7.28□□□□□ -1.24
SSF1P38789 PDB1YBR221C 1101 nt7.28□□□□□ -1.24
SSF1P38789 YTP1YNL237W 1380 nt7.28□□□□□ -1.24
SSF1P38789 WHI2YOR043W 1461 nt7.28□□□□□ -1.24
SSF1P38789 PRP19YLL036C 1512 nt7.27□□□□□ -1.25
SSF1P38789 MDM31YHR194W 1740 nt7.27□□□□□ -1.25
SSF1P38789 YHR112CYHR112C 1137 nt7.27□□□□□ -1.25
SSF1P38789 AIM23YJL131C 1071 nt7.27□□□□□ -1.25
SSF1P38789 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt7.27□□□□□ -1.25
SSF1P38789 YNL226WYNL226W 411 nt7.27□□□□□ -1.25
SSF1P38789 PCS60YBR222C 1632 nt7.27□□□□□ -1.25
SSF1P38789 GPB2YAL056W 2643 nt7.26□□□□□ -1.25
SSF1P38789 ASP1YDR321W 1146 nt7.26□□□□□ -1.25
SSF1P38789 YEL068CYEL068C 333 nt7.26□□□□□ -1.25
SSF1P38789 DSD1YGL196W 1287 nt7.26□□□□□ -1.25
SSF1P38789 CLC1YGR167W 702 nt7.26□□□□□ -1.25
SSF1P38789 BCY1YIL033C 1251 nt7.26□□□□□ -1.25
SSF1P38789 COA1YIL157C 594 nt7.26□□□□□ -1.25
SSF1P38789 ELF1YKL160W 438 nt7.26□□□□□ -1.25
SSF1P38789 RPF2YKR081C 1035 nt7.26□□□□□ -1.25
SSF1P38789 ECM19YLR390W 339 nt7.26□□□□□ -1.25
SSF1P38789 HAP3YBL021C 435 nt7.26□□□□□ -1.25
SSF1P38789 CIN4YMR138W 576 nt7.26□□□□□ -1.25
SSF1P38789 YBL077WYBL077W 432 nt7.26□□□□□ -1.25
SSF1P38789 YPR015CYPR015C 744 nt7.26□□□□□ -1.25
SSF1P38789 LDB19YOR322C 2457 nt7.26□□□□□ -1.25
SSF1P38789 FOB1YDR110W 1701 nt7.26□□□□□ -1.25
SSF1P38789 RRI1YDL216C 1323 nt7.26□□□□□ -1.25
SSF1P38789 GAS2YLR343W 1668 nt7.25□□□□□ -1.25
SSF1P38789 snR63snR63 255 nt7.25□□□□□ -1.25
SSF1P38789 BUD16YEL029C 939 nt7.25□□□□□ -1.25
SSF1P38789 YIL089WYIL089W 618 nt7.25□□□□□ -1.25
SSF1P38789 COX17YLL009C 210 nt7.25□□□□□ -1.25
SSF1P38789 SLM4YBR077C 489 nt7.25□□□□□ -1.25
SSF1P38789 TAZ1YPR140W 1146 nt7.25□□□□□ -1.25
SSF1P38789 IXR1YKL032C 1794 nt7.25□□□□□ -1.25
SSF1P38789 MTF2YDL044C 1323 nt7.25□□□□□ -1.25
SSF1P38789 NEM1YHR004C 1341 nt7.25□□□□□ -1.25
SSF1P38789 HST3YOR025W 1344 nt7.25□□□□□ -1.25
SSF1P38789 GPT2YKR067W 2232 nt7.24□□□□□ -1.25
SSF1P38789 RRG1YDR065W 1098 nt7.24□□□□□ -1.25
SSF1P38789 YDR124WYDR124W 975 nt7.24□□□□□ -1.25
SSF1P38789 TIM21YGR033C 720 nt7.24□□□□□ -1.25
SSF1P38789 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt7.24□□□□□ -1.25
SSF1P38789 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt7.24□□□□□ -1.25
SSF1P38789 YOL107WYOL107W 1029 nt7.24□□□□□ -1.25
SSF1P38789 PEX27YOR193W 1131 nt7.24□□□□□ -1.25
SSF1P38789 FHL1YPR104C 2811 nt7.23□□□□□ -1.25
SSF1P38789 CLN2YPL256C 1638 nt7.23□□□□□ -1.25
SSF1P38789 ARG81YML099C 2643 nt7.23□□□□□ -1.25
SSF1P38789 EDC3YEL015W 1656 nt7.23□□□□□ -1.25
SSF1P38789 PTC1YDL006W 846 nt7.23□□□□□ -1.25
SSF1P38789 ARP1YHR129C 1155 nt7.23□□□□□ -1.25
SSF1P38789 RPR2YIR015W 435 nt7.23□□□□□ -1.25
SSF1P38789 MID2YLR332W 1131 nt7.23□□□□□ -1.25
SSF1P38789 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt7.23□□□□□ -1.25
SSF1P38789 RPL3YOR063W 1164 nt7.23□□□□□ -1.25
SSF1P38789 ADE12YNL220W 1302 nt7.23□□□□□ -1.25
SSF1P38789 DUG1YFR044C 1446 nt7.22□□□□□ -1.25
SSF1P38789 GTT3YEL017W 1014 nt7.22□□□□□ -1.25
SSF1P38789 GRE3YHR104W 984 nt7.22□□□□□ -1.25
SSF1P38789 PGA2YNL149C 390 nt7.22□□□□□ -1.25
SSF1P38789 TLG2YOL018C 1194 nt7.22□□□□□ -1.25
SSF1P38789 YOR200WYOR200W 399 nt7.22□□□□□ -1.25
SSF1P38789 YPR114WYPR114W 948 nt7.22□□□□□ -1.25
SSF1P38789 RIT1YMR283C 1542 nt7.22□□□□□ -1.25
SSF1P38789 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt7.21□□□□□ -1.26
SSF1P38789 CHO1YER026C 831 nt7.21□□□□□ -1.26
SSF1P38789 MER1YNL210W 813 nt7.21□□□□□ -1.26
SSF1P38789 ATG29YPL166W 642 nt7.21□□□□□ -1.26
SSF1P38789 snR189snR189 189 nt7.21□□□□□ -1.26
SSF1P38789 NOP2YNL061W 1857 nt7.21□□□□□ -1.26
SSF1P38789 AIM10YER087W 1731 nt7.21□□□□□ -1.26
SSF1P38789 PRD1YCL057W 2139 nt7.21□□□□□ -1.26
SSF1P38789 SDA1YGR245C 2304 nt7.21□□□□□ -1.26
SSF1P38789 GPA2YER020W 1350 nt7.2□□□□□ -1.26
SSF1P38789 GUD1YDL238C 1470 nt7.2□□□□□ -1.26
SSF1P38789 AIM6YDL237W 1173 nt7.2□□□□□ -1.26
SSF1P38789 CAD1YDR423C 1230 nt7.2□□□□□ -1.26
SSF1P38789 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt7.2□□□□□ -1.26
SSF1P38789 YHR054CYHR054C 1065 nt7.2□□□□□ -1.26
SSF1P38789 PRM9YAR031W 897 nt7.2□□□□□ -1.26
SSF1P38789 ATG1YGL180W 2694 nt7.2□□□□□ -1.26
SSF1P38789 PRP9YDL030W 1593 nt7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 58.7 ms