Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PNMA6AP0CW24 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms