Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF888P0CJ79 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF888P0CJ79 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF888P0CJ79 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF888P0CJ79 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF888P0CJ79 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF888P0CJ79 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF888P0CJ79 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNF888P0CJ79 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF888P0CJ79 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF888P0CJ79 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF888P0CJ79 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF888P0CJ79 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF888P0CJ79 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF888P0CJ79 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF888P0CJ79 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF888P0CJ79 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF888P0CJ79 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF888P0CJ79 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF888P0CJ79 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF888P0CJ79 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF888P0CJ79 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF888P0CJ79 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF888P0CJ79 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF888P0CJ79 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF888P0CJ79 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF888P0CJ79 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF888P0CJ79 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF888P0CJ79 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF888P0CJ79 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF888P0CJ79 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF888P0CJ79 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms