Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
APODP05090 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APODP05090 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APODP05090 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APODP05090 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APODP05090 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APODP05090 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
APODP05090 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APODP05090 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APODP05090 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
APODP05090 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APODP05090 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APODP05090 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APODP05090 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APODP05090 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
APODP05090 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APODP05090 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APODP05090 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APODP05090 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APODP05090 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APODP05090 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APODP05090 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APODP05090 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APODP05090 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APODP05090 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APODP05090 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APODP05090 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APODP05090 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
APODP05090 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APODP05090 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
APODP05090 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APODP05090 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APODP05090 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APODP05090 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APODP05090 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APODP05090 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APODP05090 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APODP05090 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APODP05090 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APODP05090 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APODP05090 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APODP05090 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APODP05090 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APODP05090 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APODP05090 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APODP05090 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APODP05090 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APODP05090 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APODP05090 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APODP05090 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APODP05090 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APODP05090 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APODP05090 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APODP05090 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
APODP05090 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
APODP05090 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APODP05090 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APODP05090 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APODP05090 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APODP05090 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APODP05090 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APODP05090 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APODP05090 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APODP05090 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APODP05090 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APODP05090 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APODP05090 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APODP05090 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APODP05090 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APODP05090 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
APODP05090 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APODP05090 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
APODP05090 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APODP05090 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APODP05090 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APODP05090 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APODP05090 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APODP05090 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APODP05090 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APODP05090 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APODP05090 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APODP05090 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APODP05090 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
APODP05090 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APODP05090 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APODP05090 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APODP05090 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APODP05090 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APODP05090 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APODP05090 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APODP05090 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APODP05090 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APODP05090 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
APODP05090 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APODP05090 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APODP05090 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APODP05090 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APODP05090 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APODP05090 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APODP05090 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms