Protein–RNA interactions for Protein: O95347

SMC2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2O95347 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC2O95347 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC2O95347 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC2O95347 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC2O95347 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC2O95347 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC2O95347 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC2O95347 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC2O95347 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC2O95347 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC2O95347 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC2O95347 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC2O95347 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC2O95347 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC2O95347 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC2O95347 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC2O95347 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC2O95347 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC2O95347 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC2O95347 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC2O95347 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC2O95347 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC2O95347 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC2O95347 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC2O95347 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC2O95347 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMC2O95347 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMC2O95347 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMC2O95347 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMC2O95347 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMC2O95347 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMC2O95347 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMC2O95347 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMC2O95347 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMC2O95347 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMC2O95347 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMC2O95347 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMC2O95347 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMC2O95347 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SMC2O95347 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMC2O95347 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMC2O95347 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMC2O95347 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMC2O95347 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMC2O95347 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMC2O95347 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SMC2O95347 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMC2O95347 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMC2O95347 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMC2O95347 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMC2O95347 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SMC2O95347 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMC2O95347 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMC2O95347 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMC2O95347 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMC2O95347 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMC2O95347 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMC2O95347 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMC2O95347 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMC2O95347 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMC2O95347 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMC2O95347 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMC2O95347 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMC2O95347 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMC2O95347 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMC2O95347 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMC2O95347 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMC2O95347 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMC2O95347 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMC2O95347 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMC2O95347 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMC2O95347 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMC2O95347 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMC2O95347 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMC2O95347 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMC2O95347 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMC2O95347 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMC2O95347 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMC2O95347 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMC2O95347 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMC2O95347 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMC2O95347 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMC2O95347 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SMC2O95347 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMC2O95347 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMC2O95347 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMC2O95347 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMC2O95347 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMC2O95347 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMC2O95347 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMC2O95347 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMC2O95347 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMC2O95347 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMC2O95347 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMC2O95347 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMC2O95347 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMC2O95347 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMC2O95347 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMC2O95347 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMC2O95347 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms