Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TULP1O00294 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TULP1O00294 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP1O00294 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP1O00294 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP1O00294 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP1O00294 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP1O00294 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP1O00294 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP1O00294 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TULP1O00294 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TULP1O00294 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TULP1O00294 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TULP1O00294 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TULP1O00294 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TULP1O00294 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TULP1O00294 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TULP1O00294 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TULP1O00294 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TULP1O00294 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TULP1O00294 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TULP1O00294 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TULP1O00294 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TULP1O00294 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TULP1O00294 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TULP1O00294 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TULP1O00294 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TULP1O00294 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TULP1O00294 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TULP1O00294 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TULP1O00294 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TULP1O00294 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TULP1O00294 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TULP1O00294 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TULP1O00294 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TULP1O00294 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TULP1O00294 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TULP1O00294 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TULP1O00294 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TULP1O00294 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TULP1O00294 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TULP1O00294 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TULP1O00294 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TULP1O00294 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TULP1O00294 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TULP1O00294 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TULP1O00294 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TULP1O00294 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TULP1O00294 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TULP1O00294 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TULP1O00294 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TULP1O00294 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TULP1O00294 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TULP1O00294 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TULP1O00294 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TULP1O00294 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TULP1O00294 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TULP1O00294 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TULP1O00294 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP1O00294 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP1O00294 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP1O00294 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP1O00294 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP1O00294 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP1O00294 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP1O00294 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP1O00294 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP1O00294 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP1O00294 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP1O00294 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP1O00294 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP1O00294 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP1O00294 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP1O00294 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP1O00294 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP1O00294 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP1O00294 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP1O00294 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP1O00294 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP1O00294 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP1O00294 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP1O00294 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TULP1O00294 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TULP1O00294 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TULP1O00294 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TULP1O00294 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TULP1O00294 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TULP1O00294 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TULP1O00294 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TULP1O00294 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TULP1O00294 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TULP1O00294 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TULP1O00294 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TULP1O00294 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TULP1O00294 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TULP1O00294 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TULP1O00294 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TULP1O00294 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TULP1O00294 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TULP1O00294 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms