Protein–RNA interactions for Protein: F5H4B4

FAM227A, Protein FAM227A, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227AF5H4B4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.5 ms