Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
V9GYQ6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
V9GYQ6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
V9GYQ6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
V9GYQ6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
V9GYQ6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
V9GYQ6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
V9GYQ6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
V9GYQ6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
V9GYQ6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
V9GYQ6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
V9GYQ6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
V9GYQ6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
V9GYQ6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
V9GYQ6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
V9GYQ6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
V9GYQ6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
V9GYQ6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
V9GYQ6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
V9GYQ6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
V9GYQ6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
V9GYQ6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
V9GYQ6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
V9GYQ6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
V9GYQ6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
V9GYQ6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
V9GYQ6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
V9GYQ6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
V9GYQ6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
V9GYQ6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
V9GYQ6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
V9GYQ6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
V9GYQ6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
V9GYQ6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
V9GYQ6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
V9GYQ6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
V9GYQ6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
V9GYQ6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
V9GYQ6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
V9GYQ6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
V9GYQ6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
V9GYQ6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
V9GYQ6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
V9GYQ6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
V9GYQ6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
V9GYQ6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
V9GYQ6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
V9GYQ6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
V9GYQ6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
V9GYQ6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
V9GYQ6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
V9GYQ6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
V9GYQ6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
V9GYQ6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
V9GYQ6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
V9GYQ6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
V9GYQ6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
V9GYQ6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
V9GYQ6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
V9GYQ6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
V9GYQ6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
V9GYQ6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
V9GYQ6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
V9GYQ6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
V9GYQ6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
V9GYQ6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
V9GYQ6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
V9GYQ6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
V9GYQ6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
V9GYQ6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
V9GYQ6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
V9GYQ6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
V9GYQ6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
V9GYQ6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
V9GYQ6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
V9GYQ6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
V9GYQ6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
V9GYQ6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
V9GYQ6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
V9GYQ6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
V9GYQ6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
V9GYQ6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
V9GYQ6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
V9GYQ6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
V9GYQ6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
V9GYQ6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
V9GYQ6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
V9GYQ6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
V9GYQ6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
V9GYQ6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
V9GYQ6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
V9GYQ6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
V9GYQ6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
V9GYQ6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
V9GYQ6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
V9GYQ6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
V9GYQ6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
V9GYQ6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
V9GYQ6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
V9GYQ6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms