Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB23Q9ULC3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms