Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR7

CCDC177, Coiled-coil domain-containing protein 177, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC177Q9NQR7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC177Q9NQR7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC177Q9NQR7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC177Q9NQR7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC177Q9NQR7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC177Q9NQR7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC177Q9NQR7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC177Q9NQR7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC177Q9NQR7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC177Q9NQR7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC177Q9NQR7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC177Q9NQR7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC177Q9NQR7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC177Q9NQR7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC177Q9NQR7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC177Q9NQR7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC177Q9NQR7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC177Q9NQR7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC177Q9NQR7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms