Protein–RNA interactions for Protein: Q96T68

SETDB2, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB2, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETDB2Q96T68 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SETDB2Q96T68 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SETDB2Q96T68 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SETDB2Q96T68 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SETDB2Q96T68 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SETDB2Q96T68 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SETDB2Q96T68 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SETDB2Q96T68 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SETDB2Q96T68 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SETDB2Q96T68 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SETDB2Q96T68 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SETDB2Q96T68 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SETDB2Q96T68 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SETDB2Q96T68 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SETDB2Q96T68 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1285.2 ms