Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
LTBP4Q8N2S1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LTBP4Q8N2S1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LTBP4Q8N2S1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LTBP4Q8N2S1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LTBP4Q8N2S1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LTBP4Q8N2S1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LTBP4Q8N2S1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LTBP4Q8N2S1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LTBP4Q8N2S1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LTBP4Q8N2S1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LTBP4Q8N2S1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LTBP4Q8N2S1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LTBP4Q8N2S1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LTBP4Q8N2S1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LTBP4Q8N2S1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LTBP4Q8N2S1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
LTBP4Q8N2S1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LTBP4Q8N2S1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LTBP4Q8N2S1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LTBP4Q8N2S1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LTBP4Q8N2S1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LTBP4Q8N2S1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LTBP4Q8N2S1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LTBP4Q8N2S1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LTBP4Q8N2S1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LTBP4Q8N2S1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LTBP4Q8N2S1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LTBP4Q8N2S1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LTBP4Q8N2S1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LTBP4Q8N2S1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LTBP4Q8N2S1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
LTBP4Q8N2S1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
LTBP4Q8N2S1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
LTBP4Q8N2S1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
LTBP4Q8N2S1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LTBP4Q8N2S1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LTBP4Q8N2S1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LTBP4Q8N2S1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LTBP4Q8N2S1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LTBP4Q8N2S1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LTBP4Q8N2S1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LTBP4Q8N2S1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LTBP4Q8N2S1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LTBP4Q8N2S1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LTBP4Q8N2S1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LTBP4Q8N2S1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LTBP4Q8N2S1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LTBP4Q8N2S1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LTBP4Q8N2S1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LTBP4Q8N2S1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LTBP4Q8N2S1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LTBP4Q8N2S1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
LTBP4Q8N2S1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
LTBP4Q8N2S1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
LTBP4Q8N2S1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
LTBP4Q8N2S1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
LTBP4Q8N2S1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
LTBP4Q8N2S1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
LTBP4Q8N2S1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms