Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGA4Q8IV77 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGA4Q8IV77 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGA4Q8IV77 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGA4Q8IV77 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGA4Q8IV77 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGA4Q8IV77 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGA4Q8IV77 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGA4Q8IV77 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGA4Q8IV77 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGA4Q8IV77 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGA4Q8IV77 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGA4Q8IV77 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNGA4Q8IV77 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA4Q8IV77 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms