Protein–RNA interactions for Protein: Q6QAJ8

TMEM220, Transmembrane protein 220, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM220Q6QAJ8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM220Q6QAJ8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM220Q6QAJ8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM220Q6QAJ8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM220Q6QAJ8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM220Q6QAJ8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM220Q6QAJ8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM220Q6QAJ8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM220Q6QAJ8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM220Q6QAJ8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM220Q6QAJ8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM220Q6QAJ8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM220Q6QAJ8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM220Q6QAJ8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM220Q6QAJ8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM220Q6QAJ8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM220Q6QAJ8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM220Q6QAJ8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM220Q6QAJ8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM220Q6QAJ8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM220Q6QAJ8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM220Q6QAJ8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM220Q6QAJ8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM220Q6QAJ8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM220Q6QAJ8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM220Q6QAJ8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM220Q6QAJ8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM220Q6QAJ8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM220Q6QAJ8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM220Q6QAJ8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM220Q6QAJ8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM220Q6QAJ8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM220Q6QAJ8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms