Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms