Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNCBQ16143 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
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